В 1762–1763 годах для 1-го батальона военного гарнизона крепости святого Димитрия Ростовского был построен деревянный храм, освященный в честь Казанской иконы Божией Матери.
В 1805 году на пересечении Казанской улицы и Казанского переулка возвели новую каменную церковь во имя Казанской иконы Божией Матери. Храм имел два придела: в честь святого пророка Илии и святителя Митрофана Воронежского.
В 1860–1861 годах при старосте Романе Андреевиче Максимове церковь была расширена в западную сторону по проекту архитектора Седова. Благодаря этому крестово-купольный храм в стиле классицизма дополнили трапезной и притвором с надстроенной звонницей, выполненными в лаконичных классических формах.
В 1872 году на средства прихожан рядом с храмом построили школу.
К 1908 году приход Казанского храма насчитывал 1335 человек различных сословий, среди которых были военные, статские, купцы, мещане и иногородние. В 1916 году численность прихожан составила 1152 человека.
В 1931 году храм был разрушен советскими властями.
Возрождение Казанского храма началось в 1996 году на новом месте — в Северном жилом массиве Ростова-на-Дону, на пустыре бульвара Комарова. Средства на строительство собирали всем миром. В акции «Вложи свой кирпич в будущий храм» приняли участие более 15 тысяч жителей Дона.
На первом этапе на месте строительства был возведен молитвенный дом. В 2004 году началось строительство каменного храма. Работы шли активно, и уже через 3,5 года храм был полностью построен и расписан изнутри.
9 ноября 2008 года состоялся чин освящения храма, который возглавил архиепископ Ростовский и Новочеркасский Пантелеимон (Долганов). С этого момента Свято-Казанский храм стал духовным центром района и продолжением исторической традиции почитания Казанской иконы Божией Матери.